Центр анализа рисков и международно-правового взаимодействия в системе ВТО и других международных организаций был создан 20 марта 2015 года и является самостоятельными структурным подразделением ФГБУ «ВГНКИ». 

Центр анализа рисков осуществляет свою деятельность во взаимодействии с органами и структурными подразделениями Всемирной торговой организации, Организацией экономического сотрудничества и развития, Евразийского экономического союза, с другими международными и  межгосударственными организациями, с органами исполнительной, законодательной и судебной власти Российской Федерации, в частности, с подразделениями и подведомственными учреждениями Россельхознадзора по вопросам своей компетенции.